Znečistenie v akejkoľvek podobe má negatívny vplyv na životné prostredie a rastliny, ktoré v ňom bývajú. Znečistenie má mnoho zdrojov, od priameho vypúšťania odpadového oleja do vodných tokov po znečistenie ovzdušia výfukovými plynmi z automobilov. Niektoré účinky sú krátkodobé a ľahko sa zmierňujú. Iné účinky sú dlhodobé, pričom znečisťujúce látky pretrvávajú v životnom prostredí alebo sa hromadia v tkanivách rastlín. Fotosyntéza je nevyhnutným procesom v ekosystéme. Pomocou slnečného žiarenia, oxidu uhličitého a vody rastliny vyrábajú jedlo a energiu chemickým procesom, ktorý sa vyskytuje v listoch rastlín.
Znečistenie môže znížiť schopnosť rastliny podstúpiť fotosyntézu.Ozón a listy
Výmena plynu cez póry alebo stómy listov poskytuje potrebný oxid uhličitý pre fotosyntézu. Štúdia z roku 1980 uverejnená v Cellular and Molecular Life Sciences však zistila, že znečistenie ovzdušia znižuje veľkosť stomatózy, čo narúša výmenu plynov. Nedostatočný oxid uhličitý môže spomaliť alebo zastaviť fotosyntézu. Podporuje to štúdia z roku 2004, v ktorej sa zistilo, že znečistenie ovzdušia znižuje úrodu.
Znečisťovanie z iných zdrojov
Nešpecifické znečistenie zdroja je znečistenie, ktoré pochádza z mnohých rôznych zdrojov a vstupuje do životného prostredia prostredníctvom odtoku povrchovej vody. Podľa americkej agentúry na ochranu životného prostredia (EPA) je poľnohospodársky odtok primárnym zdrojom tohto typu znečistenia. Odtok zavádza do vodných tokov pesticídy a hnojivá. Niekedy je účinok okamžitý a rastliny rýchlo odumrú. Vysoká hladina fosforu z hnojív môže spôsobiť kvitnutie rias. Kvitnutie rias predstavuje scenár, v ktorom fotosyntéza spomaľuje a nakoniec sa zastaví, pretože pokles hladiny rozpusteného kyslíka vo vode a zakalená voda bránia toku slnečného svetla do vodných prostredí.
Znečistenie pôdy
Znečistenie pôdy ovplyvňuje fotosyntézu na koreňovej úrovni. Kyslé dažde spôsobené emisiami fosílnych palív zvyšujú kyslosť pôdy, ktorá spôsobuje vznik chemickej látky a vytvára toxické ióny hliníka. Tieto ióny bránia rastlinám v prijímaní živín, čím spomaľujú proces fotosyntézy a celkový rast rastliny.
Skleníkový efekt
Prízemný ozón vytvorený skleníkovým efektom môže vytvárať nepriaznivé podmienky pre fotosyntézu. Koncentrácie skleníkových plynov, ako je oxid uhličitý, bránia uvoľňovaniu sálavého tepla z prostredia. Povrchové teploty stúpajú a zvyšujú rýchlosť odparovania. Voda sa stáva obmedzujúcim faktorom. Aby sa zachovali vzácne zdroje, rastliny uzavrú svoju stomatu, čím sa zníži dostupnosť oxidu uhličitého pre rastlinu. Pri obmedzenom množstve oxidu uhličitého a vody sa fotosyntéza spomaľuje.
Fyzické poškodenie
Znečistenie môže narušiť schopnosť rastliny podstúpiť fotosyntézu fyzikálnym poškodením listov, kde sa vyskytujú. Ozón spôsobuje stav nazývaný chloróza, pri ktorom listy rastlín žltnú z nedostatočných hladín chlorofylu. Chlorofyl je životne dôležitý pre fotosyntézu. Ak úrovne klesnú, tak aj fotosyntéza. Vo vysokých koncentráciách môže znečistenie zničiť rastlinné štruktúry, ktoré spôsobia, že rastliny zastavia výrobu potravín, aby sa vysporiadali s environmentálnymi stresmi.
